《黑客帝国动画版》由9段以《黑客帝国》系列电影世界观为基础生发出的短片组成，各篇的角度与风格各异，制作班底汇聚了日本、美国、韩国三地的动画精英。《机器复兴》讲述了MATRIX的历史。机器人不堪人类恶劣对待，终于反抗并将人类化为能源。《少年故事》讲述一名少年突然收到来自网络的召唤，而大批黑衣人开始对他展开围捕。《虚拟程序》展示了一对男女在虚拟训练程序中的片断。《世界纪录》描写一位短跑运动员在接近突破人类极限时终被系统牢牢控制。《超越极限》叙述因为系统错误，平静的街区中出现了一片超常区域。《侦探故事》描写一位侦探被步步引领着试图摆脱系统的桎梏。《矩阵化》讲述一只机器人被人类捕获并驯化的故事。《终极战役》记录了一艘飞船毁灭的经过。
演员：小野大辅 坂本真绫 诹访部顺一 福山润 大桥贤一郎 杉山纪彰 田村由香里 山下诚一郎 田中敦子 中田让治 石川界人 铃木达央 寺岛拓笃 木村良平 前野智昭 游佐浩二 朴璐美 东地宏树 梶裕贵 加藤英美里 藤村俊二 濑田宏美 宫本茉奈 花藤莲 增元拓也 榊孝辅 今村一志洋 野坂尚也 阿部薮一 佐原诚 有村百惠 伊波奈奈 君岛哲 工藤雅久 高宫彩织 堤义光 西乡彩香 林翔太 平丸拓实 福原克己 真木骏一 真中琴与 峰晃弘 弓原健史 渡边奏人
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演员：罗伯·施奈德 海瑟·格拉汉姆 郑肯 科尔姆·米尼 洛雷塔·迪瓦恩 加布里埃尔·伊格莱西亚斯 迈克尔·麦克埃尔哈顿 比尔·奈伊 杰斯·哈梅尔 扎克瑞·戈登 查尔斯·阿德勒 珍妮特·瓦尼 基思·弗格森 黛比·德里贝里 莎乐美·延斯
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